بر اساس یک تحلیل جامع که دادههای رونویسی، مکانی، تک سلولی و میکروبیوم را ادغام میکند، متابولیسم اسید صفراوی به طور مداوم در سرطان کولورکتال سرکوب شده و با پیشآگهی بیمار مرتبط است. بازبرنامهریزی متابولیک یک ویژگی شناخته شده سرطان کولورکتال است، اما سهم مسیر متابولیسم اسید صفراوی هنوز مشخص نیست.
برای بررسی ارتباط بالینی آن، محققان یک چارچوب تحلیلی یکپارچه را با ترکیب دادههای رونویسی تودهای، رونویسی تک سلولی، رونویسی مکانی و میکروبیوم روده به کار بردند. این تحلیل، سرکوب گسترده رونویسی مسیر متابولیسم اسید صفراوی در تومورهای سرطان کولورکتال را نشان داد. اعتبارسنجی تجربی، کاهش قابل توجه ژنهای مسیر نماینده، از جمله ABCA8 و ABCD2 را تایید کرد که یافتههای مولکولی را تأیید میکند.
امضای پیشآگهی ۱۵ ژنی
بر اساس این یافتهها، محققان یک امضای پیشآگهی ۱۵ ژنی بر اساس مسیر متابولیسم اسیدهای صفراوی ایجاد کردند. این امضا، ارتباط ثابتی با بقای کلی در پنج گروه مستقل بیمار نشان داد، که نشان میدهد فعالیت مسیر ممکن است ارزش پیشآگهی در سرطان روده بزرگ داشته باشد.
تحلیل تک سلولی و فضایی
آنالیز رونوشتبرداری تک سلولی نشان داد که فعالیت متابولیسم اسیدهای صفراوی در جمعیتهای سلولهای تومور اپیتلیال سرکوب شده است. رونوشتبرداری فضایی با نشان دادن اینکه فعالیت مسیر در مناطق استرومایی متاستاتیک و زیرگروه مولکولی اجماعی ۳ (CMS3) ریزمحیط تومور غنی شده است، زمینه بیولوژیکی بیشتری را اضافه کرد. این یافتهها تفاوتها در فعالیت مسیر در بخشهای سلولی و فضایی متمایز در تومورها را برجسته کرد.
ارتباط با میکروبیوم روده
این مطالعه همچنین ارتباط معناداری بین متابولیسم اسید صفراوی و ترکیب میکروبیوم های روده شناسایی کرد. فعالیت بالاتر مسیر با اعضای گروه طبقهبندی Clostridiales ارتباط مثبت و با Dorea longicatena ارتباط منفی داشت، که نشان دهنده تعامل بین متابولیسم میزبان و میکروبیوم روده است.
در مجموع، یافتهها نشان داد که سرکوب متابولیسم اسید صفراوی با پیشآگهی سرطان کولورکتال مرتبط است و ممکن است نشاندهنده یک هدف بالقوه برای مداخلات درمانی باشد.